50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2550 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 73 aa  147  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  87.67 
 
 		 73 aa  131  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  66.2 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  57.5 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  61.64 
 
 		 74 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  61.43 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  61.43 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27751  preprotein translocase subunit SecE  47.22 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2473  preprotein translocase subunit SecE  55.74 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  43.66 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2158  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271172  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1573  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  43.24 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02241  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0330084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02821  hypothetical protein  55.56 
 
 		 46 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.54079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  34.21 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.33 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  31.03 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  31.03 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  37.93 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  32.31 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.71 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  32.86 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  29.82 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  30.56 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  27.78 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  42.22 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  38.3 
 
 		 63 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2042  preprotein translocase subunit SecE  31.67 
 
 		 157 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000127265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0356  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 123 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 		 82 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 85 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0381  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 123 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  43.48 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  30.43 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  30.43 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  32.61 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4537  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0688027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>