57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_1042 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
73 aa  147  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  87.67 
 
 
73 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  64.79 
 
 
78 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  61.64 
 
 
74 aa  90.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  57.5 
 
 
81 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  51.81 
 
 
83 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  70.37 
 
 
78 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  70.37 
 
 
78 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  46.97 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  52.73 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2473  preprotein translocase subunit SecE  58.18 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27751  preprotein translocase subunit SecE  54.55 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 
80 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2158  preprotein translocase subunit SecE  56.36 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271172  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1573  preprotein translocase subunit SecE  52.73 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02241  preprotein translocase subunit SecE  50.91 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0330084  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02821  hypothetical protein  57.78 
 
 
46 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.54079  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.33 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  32.76 
 
 
127 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  32.76 
 
 
127 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  33.85 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  36.62 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  35.38 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  31.58 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  30.91 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  30.91 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  45.45 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  34.67 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  39.29 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0356  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  28.57 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  26.87 
 
 
72 aa  42.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0381  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  38.78 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3695  preprotein translocase, SecE subunit  27.63 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000548448  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  37.29 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  34.48 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  50 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  28.07 
 
 
59 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  30.3 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  32.08 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 
51 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  38.78 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  38.78 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  34.88 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  28.26 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2337  SecE subunit of protein translocation complex  37.5 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000944719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  28.26 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  32.08 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 
60 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>