69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0949 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
147 aa  297  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  97.28 
 
 
147 aa  290  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  97.28 
 
 
147 aa  290  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  56.77 
 
 
151 aa  156  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  54.73 
 
 
147 aa  146  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  48.5 
 
 
161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  41.46 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  39.1 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  39.45 
 
 
151 aa  83.6  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  37.86 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  38.51 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  47.62 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  40.45 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  44.87 
 
 
85 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  48.15 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  58.33 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  51.79 
 
 
60 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  35.23 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  39.53 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  36.99 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  38.96 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  37.65 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.5 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  33.73 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  34.31 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  46.55 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 
60 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  57.41 
 
 
210 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  38.67 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  50.88 
 
 
77 aa  53.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  30.28 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  45.61 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  43.64 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  33.87 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  30.59 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  44.44 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  33.78 
 
 
187 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  42.03 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  30.12 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  33.85 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  40.43 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  39.02 
 
 
51 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  36.99 
 
 
72 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  30.93 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  35.62 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  42.55 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  36.99 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  32.73 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  34.69 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  40.43 
 
 
125 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 
81 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  38.3 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  41.46 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2113  preprotein translocase subunit SecE  41.46 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 
126 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  29.89 
 
 
80 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>