93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0404 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0404  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 72 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.88925e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  56.9 
 
 		 80 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  55.93 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  50.88 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0272  preprotein translocase subunit SecE  56.9 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000196165  hitchhiker  0.00824344 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0209  preprotein translocase subunit SecE  48.57 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000117834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  49.12 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0201  preprotein translocase subunit SecE  55.36 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  40.38 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  48.15 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  45.16 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  44.07 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  45.16 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  53.33 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  51.06 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  35.82 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  41.38 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  41.38 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  41.38 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  41.38 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  41.38 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  41.38 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  41.38 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  41.38 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  41.38 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  41.79 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  41.38 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  40.91 
 
 		 51 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  44.68 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  43.18 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  36.99 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  42.55 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  45.1 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  34.43 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  36.92 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  39.51 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  37.33 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1149  preprotein translocase, SecE subunit  31.03 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  37.7 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  36.92 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  36.92 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4537  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0688027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  40.48 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.98 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  43.14 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  48.08 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  40.91 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  32.88 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3903  preprotein translocase subunit SecE  46 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3252  preprotein translocase subunit SecE  46 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  48.94 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  40.35 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0582  preprotein translocase subunit SecE  42 
 
 		 127 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  43.1 
 
 		 66 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  40.68 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 116 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 116 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0036  preprotein translocase, SecE subunit  41.18 
 
 		 125 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011246  hitchhiker  0.000000000049909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  25.35 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  32.73 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  32.76 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  38.71 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  30.36 
 
 		 62 aa  41.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  37.31 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3695  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000548448  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  26.09 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  38.98 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  51.11 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0040  preprotein translocase, SecE subunit  35.48 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122423  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  38.98 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  32.2 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>