39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0282 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
63 aa  128  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0313  preprotein translocase subunit SecE  66.67 
 
 
63 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123291  decreased coverage  0.0000997668 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  68.25 
 
 
63 aa  92  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  61.9 
 
 
63 aa  88.2  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  61.9 
 
 
63 aa  85.9  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  60.32 
 
 
63 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  60.32 
 
 
63 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  48.84 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.98 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  43.14 
 
 
62 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  45.65 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
59 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
59 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
59 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  36.51 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
59 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
59 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
59 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
59 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  30.51 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  30.51 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  34.48 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0238  preprotein translocase, SecE subunit  32.2 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 
60 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  33.9 
 
 
63 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  44.19 
 
 
51 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  37.1 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1493  preprotein translocase, SecE subunit  30.51 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.394674  normal  0.332847 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  32.08 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  31.03 
 
 
72 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>