68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0252 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 66 aa  128  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  56.9 
 
 		 61 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  40.68 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  38.98 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  38.71 
 
 		 62 aa  48.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  39.29 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  29.82 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  35.85 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  31.58 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  32.2 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2955  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058438  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.59 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  37.93 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  37.1 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  38.3 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  28.81 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1937  preprotein translocase, SecE subunit  37.7 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.43 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0688  putative SecE preprotein translocase subunit  40.68 
 
 		 62 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.8362399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00689  Preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 		 112 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000478021  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0171  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158213  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  34.48 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  34.48 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  30 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  30.61 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.59 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  34.48 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  37.29 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0354  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235186 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  29.09 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0667  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.986958  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  30.16 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  28.07 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  30.16 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  30.16 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  28.07 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>