89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3358 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 65 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  70 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  70 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  63.33 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  62.5 
 
 		 66 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  61.67 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  61.67 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  59.02 
 
 		 63 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  59.02 
 
 		 63 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  54.69 
 
 		 66 aa  76.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  68.42 
 
 		 62 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  74 
 
 		 62 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  64.91 
 
 		 63 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  62.71 
 
 		 63 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  60.66 
 
 		 63 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  55.74 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  61.02 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1941  preprotein translocase subunit SecE  60.94 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437033  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1211  preprotein translocase subunit SecE  60.94 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  60.94 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  55.93 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  51.56 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  50.79 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  49.18 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  56.45 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  53.97 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4443  preprotein translocase, SecE subunit  53.33 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0226  preprotein translocase subunit SecE  58.73 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  54.84 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  54.84 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  56.6 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  54.84 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1318  preprotein translocase subunit SecE  51.56 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0854776  normal  0.244779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1416  preprotein translocase subunit SecE  51.56 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.970626  normal  0.402516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5089  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  64.58 
 
 		 52 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746312  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  53.45 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0972  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  50 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3846  preprotein translocase, SecE subunit  65.57 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1825  preprotein translocase subunit SecE  53.33 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0959491  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.67 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  47.62 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  41.27 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  51.11 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  44.68 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  52.17 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  48.84 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  46.51 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  39.34 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0356  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0381  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.51 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  36.54 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  39.53 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0920  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  39.53 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  44.19 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  35.19 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  32.69 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  32.65 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3341  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101417 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.89 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 83 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0688  putative SecE preprotein translocase subunit  35.19 
 
 		 62 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.8362399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  37.74 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  44.68 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  47.62 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  34.88 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  44.23 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1493  preprotein translocase, SecE subunit  31.15 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.394674  normal  0.332847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  46.67 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4537  preprotein translocase subunit SecE  40.43 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0688027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 63 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0306  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 117 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970626  normal  0.0458537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  39.53 
 
 		 83 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  30.36 
 
 		 62 aa  40  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>