116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1055 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
64 aa  123  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  76.67 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3341  preprotein translocase subunit SecE  81.97 
 
 
61 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0920  preprotein translocase subunit SecE  80.33 
 
 
61 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0613  preprotein translocase subunit SecE  75 
 
 
61 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000809702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  55.93 
 
 
60 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0667  preprotein translocase subunit SecE  72.88 
 
 
60 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.986958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  47.46 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  49.15 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  49.09 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  45.76 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 
83 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2113  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  42.37 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  48.15 
 
 
62 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.98 
 
 
65 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
63 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
73 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 
63 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  37.29 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  36.67 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.07 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.29 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  47.17 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  47.17 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  44.26 
 
 
61 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  33.9 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  45.65 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  41.3 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  35.09 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  34.43 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04537  preprotein translocase subunit SecE  45.61 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333882  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2787  preprotein translocase, SecE subunit  45.28 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  37.1 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03857  translocase  38.46 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000542011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4014  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000048748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  37.1 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4214  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.05954e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4520  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  37.1 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  37.1 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4044  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000141034  hitchhiker  0.00697666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4469  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000281914  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  37.29 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5446  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000383194  hitchhiker  0.0067856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03810  hypothetical protein  38.46 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0688  putative SecE preprotein translocase subunit  36.21 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.8362399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4479  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000837942  decreased coverage  0.00000000000000405738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4476  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000966143  hitchhiker  0.00190417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4357  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000161707  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4389  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4553  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00306238  hitchhiker  0.000000000000770632 
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0204  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00011223  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0199  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1941  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437033  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3737  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168661  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1211  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  42.59 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  42.59 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0194  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
151 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3891  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00311904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  34.43 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 
59 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 
79 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  35.85 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  29.63 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  36.67 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 
63 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1318  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
66 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0854776  normal  0.244779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1416  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
66 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.970626  normal  0.402516 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3452  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.0121626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>