62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2168 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  100 
 
 		 86 aa  168  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  38.96 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  44.07 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  38.82 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  32.84 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  32.84 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  42.31 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  38.67 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  39.47 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  31.65 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  30.59 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  31.65 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  47.06 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  32 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  38.18 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  34.12 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  38.18 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0613  preprotein translocase subunit SecE  45.76 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000809702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.06 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  38.46 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  39.44 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  44 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.38 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  35.21 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  31.25 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4021  preprotein translocase, SecE subunit  30.43 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.962383  normal  0.504594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  42.37 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  43.59 
 
 		 51 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  29.41 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  39.76 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  36.67 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  37.68 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  29.07 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  36.07 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0437  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  42.22 
 
 		 158 aa  42.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  36.11 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  33.8 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  35.42 
 
 		 63 aa  42  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 65 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 72 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  29.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  30.14 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  31.75 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  37.74 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  31.75 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  30.19 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  35.85 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>