50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_17310 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  100 
 
 
83 aa  159  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  53.42 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  53.85 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  49.38 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  49.38 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  47.5 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  48.05 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  44.58 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  48.72 
 
 
87 aa  60.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  51.52 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  47.89 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  43.42 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  45.16 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  52.86 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  45.31 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  43.37 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  45.07 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  44.12 
 
 
158 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  44.62 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  43.28 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  48.15 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  35.06 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  46.15 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  47.37 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  52.11 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.06 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  46.3 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  39.02 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  44.44 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  48.98 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  45.76 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  43.75 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2955  preprotein translocase, SecE subunit  37.25 
 
 
59 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058438  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3891  preprotein translocase subunit SecE  48.84 
 
 
127 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00311904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3737  preprotein translocase subunit SecE  48.84 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  33.87 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  47.62 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  47.62 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  47.62 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  47.62 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4289  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
122 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573217  hitchhiker  0.00000222433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  44.23 
 
 
63 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>