89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21040 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  39.22 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  42.68 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  47.89 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  42.39 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  42.39 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  46.48 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  48.57 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  46.67 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  40.96 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  31.31 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  41.82 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  48.75 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  45.61 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  45.61 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  45.61 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  41.89 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  35.56 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.55 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  49.09 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  55.32 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  45.45 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  46.67 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  32.94 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  50.68 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  47.95 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  36.76 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.38 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  30.85 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3891  preprotein translocase subunit SecE  33.82 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00311904  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  42.59 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4469  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000281914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5446  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000383194  hitchhiker  0.0067856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03810  hypothetical protein  35 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  53.7 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4014  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000048748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4520  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4214  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.05954e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  42.59 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03857  translocase  35 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000542011  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4044  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000141034  hitchhiker  0.00697666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0204  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00011223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  33.82 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  52.38 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3737  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4357  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000161707  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4389  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4553  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00306238  hitchhiker  0.000000000000770632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4476  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000966143  hitchhiker  0.00190417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4479  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000837942  decreased coverage  0.00000000000000405738 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0199  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  48.21 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  34.83 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  34.83 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  46.77 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  28.87 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  40.91 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  40.38 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.38 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  31.03 
 
 		 126 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  36.17 
 
 		 131 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  31.03 
 
 		 126 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  31.46 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  25.77 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  36.17 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0171  preprotein translocase subunit SecE  38.3 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  44.64 
 
 		 82 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0218  preprotein translocase subunit SecE  34.04 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>