88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0304 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 61 aa  118  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  56.9 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00689  Preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000478021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  38.98 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0688  putative SecE preprotein translocase subunit  46.55 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.8362399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1937  preprotein translocase, SecE subunit  45.61 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0496  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 		 59 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3340  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  39.66 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00055  elongation factor Tu  35.71 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2955  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058438  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3195  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0644038  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4214  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.05954e-22  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4014  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000048748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4469  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000281914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4520  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4044  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000141034  hitchhiker  0.00697666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5446  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000383194  hitchhiker  0.0067856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03810  hypothetical protein  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03857  translocase  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000542011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0204  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00011223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3320  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4479  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000837942  decreased coverage  0.00000000000000405738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4476  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000966143  hitchhiker  0.00190417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4357  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000161707  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4389  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4553  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00306238  hitchhiker  0.000000000000770632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2973  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3737  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168661  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0218  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3891  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00311904  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0199  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  46.94 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3040  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  32.14 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  39.62 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  32.08 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0200  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185504  hitchhiker  0.0000981589 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0186  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  32.08 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0186  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  hitchhiker  0.00751304 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0181  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000171  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  31.67 
 
 		 65 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  31.67 
 
 		 60 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  31.67 
 
 		 65 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  32.14 
 
 		 62 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4703  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000037355  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4021  preprotein translocase, SecE subunit  44.9 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.962383  normal  0.504594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  36.54 
 
 		 89 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3452  preprotein translocase, SecE subunit  30.91 
 
 		 126 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.0121626 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 		 125 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0171  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3772  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452492  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  32.14 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  35.85 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  36.96 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  35.85 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.09 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2854  preprotein translocase subunit SecE  34.78 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.060593  normal  0.309086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  32.73 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  28.81 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  30.19 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  31.48 
 
 		 72 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0267  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.33 
 
 		 58 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0300363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>