44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2955 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2955  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 59 aa  115  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058438  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0519  preprotein translocase, SecE subunit  54.35 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4014  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000048748  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0204  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00011223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03810  hypothetical protein  41.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5446  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000383194  hitchhiker  0.0067856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4553  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00306238  hitchhiker  0.000000000000770632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4389  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4357  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000161707  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4476  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000966143  hitchhiker  0.00190417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4479  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000837942  decreased coverage  0.00000000000000405738 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4469  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000281914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4044  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000141034  hitchhiker  0.00697666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03857  translocase  41.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000542011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  33.96 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4520  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4214  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.05954e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0199  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3891  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00311904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3737  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  35.29 
 
 		 60 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  33.93 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.25 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  41.46 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0437  preprotein translocase, SecE subunit  39.22 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 126 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  37.25 
 
 		 62 aa  40  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 126 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>