180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1543 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 115 aa  226  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  36.79 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  49.12 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  40.48 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  53.7 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  32.08 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  46.43 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  50.91 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  49.12 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  34.65 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  45.45 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  48.15 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  31.19 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  31.19 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  43.64 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  30.28 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  47.92 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  34.57 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  48.94 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  38.18 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  34.21 
 
 		 72 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  38.98 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  38.33 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  34.58 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  47.92 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  36.71 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  42.59 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.04 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  34.21 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  34.12 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  42.55 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  31.58 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  43.4 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  47.06 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  35.44 
 
 		 89 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 76 aa  47.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  38.24 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  46.3 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  44.68 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  35.62 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0613  preprotein translocase subunit SecE  43.86 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000809702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0582  preprotein translocase subunit SecE  45.76 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  30.16 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  34.67 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2258  preprotein translocase subunit SecE  40.68 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3873  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  28.38 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4537  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0688027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3457  preprotein translocase subunit SecE  45.1 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164313  normal  0.4312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3351  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5089  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  39.58 
 
 		 52 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746312  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  34.72 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  43.64 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>