110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1630 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
79 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  48.19 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  49.4 
 
 
83 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  44.58 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  44.87 
 
 
82 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0504  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  40.85 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  50.94 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0040  preprotein translocase, SecE subunit  42.11 
 
 
125 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  44.83 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  40.62 
 
 
66 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.4 
 
 
63 aa  50.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0036  preprotein translocase, SecE subunit  47.83 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011246  hitchhiker  0.000000000049909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 
168 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0235  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  0.0123007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2854  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.060593  normal  0.309086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.07 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3433  preprotein translocase subunit SecE  52.38 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2773  preprotein translocase subunit SecE  52.38 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101762  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0253  preprotein translocase subunit SecE  52.38 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0223726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0334  preprotein translocase subunit SecE  52.38 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000349091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0313  preprotein translocase subunit SecE  52.38 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000158246  normal  0.139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0262  preprotein translocase subunit SecE  52.38 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3082  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0300  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3658  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000015215  hitchhiker  0.000000741444 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3792  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
126 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000246891  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  36.71 
 
 
92 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2647  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
126 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00996997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3184  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
126 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000113463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1908  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
126 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3760  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
126 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000111945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3822  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
126 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0436537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3463  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
126 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000635394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  41.54 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 
60 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  30.67 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4537  preprotein translocase subunit SecE  47.83 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0688027  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0306  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970626  normal  0.0458537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  37.66 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4289  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573217  hitchhiker  0.00000222433 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  47.92 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  39.29 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  38.6 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2227  preprotein translocase, SecE subunit  53.66 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0323574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 
60 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  51.02 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  41.94 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  33.85 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  33.85 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  33.85 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0496  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3903  preprotein translocase subunit SecE  45.65 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  45.83 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3252  preprotein translocase subunit SecE  45.65 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4448  preprotein translocase subunit SecE  47.92 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00605491  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3341  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101417 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0347  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 
59 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000107715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3452  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 
126 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.0121626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2258  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
144 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479635  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  32.84 
 
 
78 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  32.84 
 
 
78 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  38.18 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  27.27 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  27.27 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1322  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 
59 aa  41.2  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000148324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0920  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0582  preprotein translocase subunit SecE  51.28 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  29.69 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  44.68 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3598  preprotein translocase subunit SecE  41.18 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4021  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.962383  normal  0.504594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1669  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
59 aa  40.4  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00942415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>