21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0502 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
59 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
59 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
59 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1322  preprotein translocase subunit SecE  73.21 
 
 
59 aa  85.5  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000148324  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0347  preprotein translocase, SecE subunit  67.8 
 
 
59 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00337582  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0443  preprotein translocase subunit SecE  81.36 
 
 
60 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00142649  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1669  preprotein translocase subunit SecE  64.41 
 
 
59 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00942415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0347  preprotein translocase subunit SecE  63.46 
 
 
59 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000107715  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0175  preprotein translocase subunit SecE  71.19 
 
 
59 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0160208  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0168  preprotein translocase subunit SecE  66.1 
 
 
59 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0287833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.51 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  29.63 
 
 
63 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  32.14 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  32.08 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  34.48 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  34.48 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>