19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1322 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1322  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 59 aa  114  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000148324  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  73.21 
 
 		 59 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  73.21 
 
 		 59 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  73.21 
 
 		 59 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0443  preprotein translocase subunit SecE  75.86 
 
 		 60 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00142649  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0347  preprotein translocase, SecE subunit  65.52 
 
 		 59 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00337582  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0168  preprotein translocase subunit SecE  80.7 
 
 		 59 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0287833  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0175  preprotein translocase subunit SecE  75.86 
 
 		 59 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0160208  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1669  preprotein translocase subunit SecE  62.5 
 
 		 59 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00942415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0347  preprotein translocase subunit SecE  52 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000107715  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  38.71 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.14 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  33.87 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  32.08 
 
 		 125 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  36.36 
 
 		 132 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0040  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122423  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0036  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 125 aa  41.2  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011246  hitchhiker  0.000000000049909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  29.82 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>