15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0168 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0168  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
59 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0287833  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1322  preprotein translocase subunit SecE  79.31 
 
 
59 aa  90.9  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000148324  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0175  preprotein translocase subunit SecE  86.44 
 
 
59 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0160208  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  66.1 
 
 
59 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  66.1 
 
 
59 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  66.1 
 
 
59 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0347  preprotein translocase, SecE subunit  66.1 
 
 
59 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00337582  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0443  preprotein translocase subunit SecE  72.88 
 
 
60 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00142649  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1669  preprotein translocase subunit SecE  61.02 
 
 
59 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00942415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0347  preprotein translocase subunit SecE  50.94 
 
 
59 aa  60.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000107715  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  30.51 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  29.63 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>