13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0175 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0175  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
59 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0160208  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1322  preprotein translocase subunit SecE  75.86 
 
 
59 aa  88.2  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000148324  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0347  preprotein translocase, SecE subunit  71.19 
 
 
59 aa  84.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00337582  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  71.19 
 
 
59 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  71.19 
 
 
59 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  71.19 
 
 
59 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0168  preprotein translocase subunit SecE  86.44 
 
 
59 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0287833  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0443  preprotein translocase subunit SecE  83.05 
 
 
60 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00142649  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1669  preprotein translocase subunit SecE  59.32 
 
 
59 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00942415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0347  preprotein translocase subunit SecE  56.6 
 
 
59 aa  60.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000107715  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  32.2 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  29.31 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.51 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>