13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0347 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0347  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 
59 aa  114  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00337582  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1322  preprotein translocase subunit SecE  65.52 
 
 
59 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000148324  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  67.8 
 
 
59 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  67.8 
 
 
59 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  67.8 
 
 
59 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1669  preprotein translocase subunit SecE  62.71 
 
 
59 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00942415  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0443  preprotein translocase subunit SecE  71.19 
 
 
60 aa  72  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00142649  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0175  preprotein translocase subunit SecE  71.19 
 
 
59 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0160208  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0347  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
59 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000107715  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0168  preprotein translocase subunit SecE  66.1 
 
 
59 aa  57  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0287833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.9 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  31.58 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>