19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0443 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0443  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 60 aa  117  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00142649  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1322  preprotein translocase subunit SecE  75.86 
 
 		 59 aa  94.7  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000148324  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  81.36 
 
 		 59 aa  90.9  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  81.36 
 
 		 59 aa  90.9  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  81.36 
 
 		 59 aa  90.9  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0347  preprotein translocase, SecE subunit  71.19 
 
 		 59 aa  88.6  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00337582  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0175  preprotein translocase subunit SecE  83.05 
 
 		 59 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0160208  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1669  preprotein translocase subunit SecE  59.32 
 
 		 59 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00942415  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0168  preprotein translocase subunit SecE  72.88 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0287833  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0347  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000107715  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  37.29 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  42.59 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  30.51 
 
 		 124 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  32.69 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  32.2 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>