24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1669 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1669  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 59 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00942415  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0347  preprotein translocase, SecE subunit  62.71 
 
 		 59 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00337582  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  64.41 
 
 		 59 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  64.41 
 
 		 59 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  64.41 
 
 		 59 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1322  preprotein translocase subunit SecE  62.5 
 
 		 59 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000148324  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0347  preprotein translocase subunit SecE  60 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000107715  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0443  preprotein translocase subunit SecE  59.32 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00142649  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0175  preprotein translocase subunit SecE  59.32 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0160208  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0168  preprotein translocase subunit SecE  61.02 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0287833  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  41.18 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.84 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  37.25 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  32.2 
 
 		 60 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 80 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  35.29 
 
 		 115 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>