54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1968 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 63 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  90.48 
 
 		 63 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  85.71 
 
 		 63 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  80.95 
 
 		 63 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  85.71 
 
 		 63 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0313  preprotein translocase subunit SecE  69.84 
 
 		 63 aa  90.5  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123291  decreased coverage  0.0000997668 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  61.9 
 
 		 63 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  42.59 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  39.66 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  48.84 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  42.59 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  48.84 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0218  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0186  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  hitchhiker  0.00751304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3772  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0186  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0181  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000171  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1322  preprotein translocase subunit SecE  33.87 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000148324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  47.83 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4703  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000037355  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  40.82 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0267  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.5 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0300363  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0684  preprotein translocase, SecE subunit  34.78 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000000414413  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0347  preprotein translocase, SecE subunit  31.58 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00337582  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  32.08 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  32.08 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  32.08 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  42.55 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0238  preprotein translocase, SecE subunit  45 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  41.46 
 
 		 51 aa  41.2  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  37.25 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  44.19 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  29.82 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  29.82 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  28.85 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3873  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  37.25 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  32.73 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  41.03 
 
 		 76 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.23 
 
 		 83 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>