68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4006 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 
92 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  53.85 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  56.58 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  53.42 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  52.63 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  46.75 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  52.63 
 
 
93 aa  67  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  40.96 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  58.49 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  40.48 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  44.64 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  46.43 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  44.07 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  38.96 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  38.96 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  38.96 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  46.43 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  52.83 
 
 
60 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  47.62 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  57.45 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  46.67 
 
 
136 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  44.83 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  39.73 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  52.17 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
85 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
75 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  43.75 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  45.45 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  47.17 
 
 
60 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  37.8 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  44.29 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
60 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
60 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  36.71 
 
 
79 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  43.42 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  46.67 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  53.57 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  51.11 
 
 
59 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  51.11 
 
 
59 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  39.22 
 
 
60 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  46.15 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  48.89 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  46.15 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  46.67 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  46.51 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  31.17 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  32.84 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  46.67 
 
 
115 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  34.38 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  32.18 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  30.14 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  35.21 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0582  preprotein translocase subunit SecE  46.67 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2258  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
144 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>