88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0908 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 89 aa  179  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  53.41 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  49.44 
 
 		 87 aa  84.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  48.31 
 
 		 89 aa  83.6  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  56.76 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  47.5 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  44.19 
 
 		 136 aa  76.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  40.45 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  50.77 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  48.48 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  39.33 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  39.33 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  44.94 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  52.33 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  58.33 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  48.15 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  36.17 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  53.97 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  41.57 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  45.16 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  46.77 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  56.67 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  46.43 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  50.72 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  40.48 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  44.71 
 
 		 84 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  40.24 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  44.9 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  50.72 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.42 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  56.9 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  46.97 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  56.36 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  47.5 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  43.94 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  45.28 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  39.13 
 
 		 187 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  62.96 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  47.46 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  56.6 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  34.38 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  49.06 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  40.68 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  35.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  37.29 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  32 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  35.44 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  43.1 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  30.67 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 59 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  25 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3340  preprotein translocase subunit SecE  48.08 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  32.26 
 
 		 83 aa  43.5  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  38.03 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2113  preprotein translocase subunit SecE  47.73 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307144  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  47.73 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  26.37 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  55 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  33.82 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  52.5 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  47.92 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3040  preprotein translocase subunit SecE  46.15 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3320  preprotein translocase subunit SecE  46.15 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2973  preprotein translocase subunit SecE  46.15 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 80 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 61 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  32.08 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  32.2 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  46.3 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  40.43 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  31.03 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3873  preprotein translocase subunit SecE  45.1 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3195  preprotein translocase subunit SecE  44.23 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0644038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  28 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  39.71 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0519  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 		 68 aa  40  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>