72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4526 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 210 aa  403  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  75.44 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  53.26 
 
 		 125 aa  92.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  45.38 
 
 		 136 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  43.75 
 
 		 151 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  40.82 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  43.08 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  39.81 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  39.81 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  39.81 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  75 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  61.11 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  53.16 
 
 		 85 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  51.25 
 
 		 84 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  39.29 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  32.12 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  44.94 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  44.3 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  40.91 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.74 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  61.02 
 
 		 87 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  38.27 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  55.56 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  34.94 
 
 		 88 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  49.06 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  61.11 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  44.64 
 
 		 65 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  44.64 
 
 		 65 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  49.25 
 
 		 83 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  53.85 
 
 		 77 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  48 
 
 		 92 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 		 115 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 60 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  55.81 
 
 		 79 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  38.16 
 
 		 81 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  48 
 
 		 63 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  53.7 
 
 		 98 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  34.04 
 
 		 51 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  30.99 
 
 		 75 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 81 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  32.91 
 
 		 129 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 65 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0226  preprotein translocase subunit SecE  40.98 
 
 		 65 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  36.73 
 
 		 64 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 78 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 66 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  41.56 
 
 		 84 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 78 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.68 
 
 		 86 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  35.14 
 
 		 80 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0385  preprotein translocase, SecE subunit  45.12 
 
 		 86 aa  42.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 		 66 aa  42.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 62 aa  42.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  26.92 
 
 		 80 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  25.71 
 
 		 85 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 		 60 aa  42  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 127 aa  42.4  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  42.55 
 
 		 130 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  30.99 
 
 		 75 aa  42  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  30.19 
 
 		 89 aa  42  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  39.13 
 
 		 65 aa  42  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  38.78 
 
 		 63 aa  42  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  28.12 
 
 		 80 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  45.45 
 
 		 96 aa  41.6  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  36.73 
 
 		 64 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  36.73 
 
 		 64 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  26.98 
 
 		 80 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  36.73 
 
 		 64 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>