59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2996 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 107 aa  215  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  79.78 
 
 		 89 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  57.83 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  56.32 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  58.67 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  52.56 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  45.16 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  58.33 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  56.58 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  46.59 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  47.06 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  44.94 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  61.43 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  48.86 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  48.28 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  49.38 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  40.54 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  44.59 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  48.44 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  44.3 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  62 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  47.19 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  49.12 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  29.13 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  43.33 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  35.29 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  35.29 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  34.31 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  47.89 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  45.88 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  42.65 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  51.85 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  53.7 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  38.27 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  38.27 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  43.86 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  53.45 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09680  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00103622  hitchhiker  0.00000745581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  39.66 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  36.23 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  35.37 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  29.07 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  36.07 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  37.63 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  52.73 
 
 		 82 aa  42  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  44.19 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  33.85 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  45.65 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  29.03 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  38.16 
 
 		 72 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  30.86 
 
 		 83 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>