23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02241 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
80 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  97.5 
 
 
80 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  93.75 
 
 
80 aa  153  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  77.65 
 
 
85 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1573  preprotein translocase subunit SecE  59.49 
 
 
80 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02241  preprotein translocase subunit SecE  70.31 
 
 
80 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0330084  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27751  preprotein translocase subunit SecE  66.18 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2473  preprotein translocase subunit SecE  54.43 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2158  preprotein translocase subunit SecE  57.5 
 
 
160 aa  90.5  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271172  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02821  hypothetical protein  75.56 
 
 
46 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.54079  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  46.97 
 
 
73 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  45.21 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  43.66 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  51.85 
 
 
78 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  51.85 
 
 
78 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  44 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  49.09 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  25.76 
 
 
127 aa  42.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  25.76 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  25.71 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  29.89 
 
 
147 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>