86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0636 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 81 aa  159  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  57.14 
 
 		 83 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  61.64 
 
 		 74 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  57.5 
 
 		 73 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  57.5 
 
 		 73 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  52.5 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  64.81 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  64.81 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2158  preprotein translocase subunit SecE  52.94 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271172  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2473  preprotein translocase subunit SecE  66.04 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27751  preprotein translocase subunit SecE  48.1 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1573  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  43.24 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  49.09 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02241  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0330084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  44.62 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02821  hypothetical protein  59.52 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.54079  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0356  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0381  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  32.79 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  37.7 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  31.03 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  29.85 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  36.49 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.67 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  32.26 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.67 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  35.29 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  36.73 
 
 		 51 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  38 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  37.25 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  45.45 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  29.63 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  35.8 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  36.23 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  40.43 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  32.76 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  32.26 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  34.25 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  35.19 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1416  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.970626  normal  0.402516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  39.13 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1318  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0854776  normal  0.244779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2337  SecE subunit of protein translocation complex  43.1 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000944719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  38.03 
 
 		 89 aa  43.9  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  37.04 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  30.99 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  34 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  32.69 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  34.78 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0226  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  38.64 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  28.81 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  31.15 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  32.76 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0972  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  32.08 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1211  preprotein translocase subunit SecE  30.99 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  34.78 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 147 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2113  preprotein translocase subunit SecE  34.38 
 
 		 135 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307144  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 147 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  39.66 
 
 		 210 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 147 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  29.82 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  28 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  25 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  29.82 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  41.03 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3457  preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164313  normal  0.4312 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  28.57 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  28.57 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1941  preprotein translocase subunit SecE  30.65 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  30.56 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 72 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>