20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1573 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1573  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 80 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02241  preprotein translocase subunit SecE  72.73 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0330084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  60 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2158  preprotein translocase subunit SecE  61.25 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271172  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  62.03 
 
 		 80 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  59.49 
 
 		 80 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  58.33 
 
 		 80 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2473  preprotein translocase subunit SecE  61.73 
 
 		 96 aa  97.1  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02821  hypothetical protein  100 
 
 		 46 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.54079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27751  preprotein translocase subunit SecE  60.53 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  49.33 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  51.85 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  51.85 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  52.73 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  43.84 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  50.94 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  29.51 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  29.51 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>