21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2473 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2473  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 96 aa  189  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2158  preprotein translocase subunit SecE  82.72 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271172  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27751  preprotein translocase subunit SecE  65.17 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1573  preprotein translocase subunit SecE  61.73 
 
 		 80 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  55.84 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02241  preprotein translocase subunit SecE  72.13 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0330084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  55.7 
 
 		 80 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  54.88 
 
 		 80 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  54.43 
 
 		 80 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02821  hypothetical protein  80.43 
 
 		 46 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.54079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  52 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  52 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  66.04 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  56.6 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  58.18 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  48.53 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  55.74 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  54.72 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  38.18 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  34.62 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>