57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1022 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 78 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  70.51 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  70.51 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  66.2 
 
 		 73 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  64.79 
 
 		 73 aa  93.6  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  60.56 
 
 		 74 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  52.5 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  51.81 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2158  preprotein translocase subunit SecE  46.15 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271172  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2473  preprotein translocase subunit SecE  48.53 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27751  preprotein translocase subunit SecE  43.42 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1573  preprotein translocase subunit SecE  49.33 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02241  preprotein translocase subunit SecE  56.6 
 
 		 80 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0330084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  47.3 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  42.67 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  41.56 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02821  hypothetical protein  57.78 
 
 		 46 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.54079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.25 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  40 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  38.03 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0356  preprotein translocase subunit SecE  42.31 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0381  preprotein translocase subunit SecE  42.31 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  34 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  32.43 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4289  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573217  hitchhiker  0.00000222433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  32 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  29.33 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2042  preprotein translocase subunit SecE  37.21 
 
 		 157 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000127265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.82 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  27.27 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  38.89 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  27.27 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  32.47 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  34.21 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.67 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  28.12 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2337  SecE subunit of protein translocation complex  43.75 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000944719  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  32.14 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1893  preprotein translocase subunit SecE  34.88 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0127051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2183  preprotein translocase subunit SecE  34.88 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0165979  decreased coverage  0.00917802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  29.33 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  29.49 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  30.36 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  28 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4448  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00605491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  36.84 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0306  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 117 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970626  normal  0.0458537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  36 
 
 		 62 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>