22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2158 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2158  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 160 aa  327  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271172  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2473  preprotein translocase subunit SecE  82.72 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27751  preprotein translocase subunit SecE  75 
 
 		 90 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1573  preprotein translocase subunit SecE  61.25 
 
 		 80 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  57.65 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02241  preprotein translocase subunit SecE  70.77 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0330084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  56.96 
 
 		 80 aa  90.9  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  55.7 
 
 		 80 aa  90.5  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  57.5 
 
 		 80 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02821  hypothetical protein  82.61 
 
 		 46 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.54079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  50.67 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  50.67 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  52.94 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  42.68 
 
 		 83 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  46.15 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  56.36 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  38.46 
 
 		 127 aa  45.4  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  29.58 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>