67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1766 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 78 aa  156  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 78 aa  156  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  70.51 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  58.97 
 
 		 74 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  55.26 
 
 		 83 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  64.81 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  61.43 
 
 		 73 aa  80.1  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  70.37 
 
 		 73 aa  80.1  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2158  preprotein translocase subunit SecE  50.67 
 
 		 160 aa  76.6  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271172  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2473  preprotein translocase subunit SecE  52 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27751  preprotein translocase subunit SecE  50.72 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02241  preprotein translocase subunit SecE  53.7 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0330084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  43.04 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 		 80 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1573  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02821  hypothetical protein  59.52 
 
 		 46 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.54079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  38.98 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  38.89 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  46.67 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.46 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  31.67 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  35.9 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  30.43 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.46 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  34.78 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  34.78 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0356  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  40.82 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0381  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  35.94 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  41.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  28.17 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  29.58 
 
 		 151 aa  42  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  30.19 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  32.61 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  26.56 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  37.74 
 
 		 80 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  36.96 
 
 		 130 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  32.84 
 
 		 79 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.33 
 
 		 63 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  29.79 
 
 		 59 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  32.81 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  34.04 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2042  preprotein translocase subunit SecE  32 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000127265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  32.86 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  31.25 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  36.73 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  35.19 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  31.75 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  31.91 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1211  preprotein translocase subunit SecE  32.81 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  35.42 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  32.35 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0972  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  31.25 
 
 		 62 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  28.81 
 
 		 103 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  31.25 
 
 		 63 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>