21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27751 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_27751  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
90 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2158  preprotein translocase subunit SecE  65.17 
 
 
160 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271172  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2473  preprotein translocase subunit SecE  65.17 
 
 
96 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  66.18 
 
 
80 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  53.93 
 
 
80 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  51.69 
 
 
85 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02241  preprotein translocase subunit SecE  70.97 
 
 
80 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0330084  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1573  preprotein translocase subunit SecE  60.53 
 
 
80 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  63.24 
 
 
80 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02821  hypothetical protein  82.22 
 
 
46 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.54079  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  50.72 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  50.72 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  48.1 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  42.5 
 
 
83 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  43.42 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  54.55 
 
 
73 aa  64.3  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  47.22 
 
 
73 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  56.6 
 
 
74 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  40.62 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  34.55 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>