23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0208 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02241  preprotein translocase subunit SecE  93.75 
 
 
80 aa  153  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  92.5 
 
 
80 aa  151  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  76.47 
 
 
85 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1573  preprotein translocase subunit SecE  62.03 
 
 
80 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02241  preprotein translocase subunit SecE  70.31 
 
 
80 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0330084  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2473  preprotein translocase subunit SecE  54.88 
 
 
96 aa  94.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27751  preprotein translocase subunit SecE  63.24 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2158  preprotein translocase subunit SecE  56.96 
 
 
160 aa  90.9  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271172  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02821  hypothetical protein  75.56 
 
 
46 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.54079  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  43.84 
 
 
74 aa  63.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  51.85 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
81 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
73 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  41.56 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 
125 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  25.76 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  32.18 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  28.33 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>