180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2078 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 
82 aa  158  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  51.81 
 
 
83 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  49.38 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  48.15 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  43.55 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2787  preprotein translocase, SecE subunit  55.84 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  50.91 
 
 
60 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  44.87 
 
 
79 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  47.46 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3252  preprotein translocase subunit SecE  54.72 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3903  preprotein translocase subunit SecE  54.72 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3341  preprotein translocase subunit SecE  47.46 
 
 
61 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101417 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2258  preprotein translocase subunit SecE  49.15 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479635  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0920  preprotein translocase subunit SecE  45.76 
 
 
61 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  53.7 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4537  preprotein translocase subunit SecE  50.94 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0688027  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3873  preprotein translocase subunit SecE  57.78 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0306  preprotein translocase subunit SecE  55.1 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970626  normal  0.0458537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3320  preprotein translocase subunit SecE  50.88 
 
 
126 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160512  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2973  preprotein translocase subunit SecE  51.79 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  45.76 
 
 
64 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0582  preprotein translocase subunit SecE  53.06 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4448  preprotein translocase subunit SecE  55.1 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00605491  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3040  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3340  preprotein translocase subunit SecE  49.12 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3457  preprotein translocase subunit SecE  57.78 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164313  normal  0.4312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3195  preprotein translocase subunit SecE  49.12 
 
 
126 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0644038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0504  preprotein translocase subunit SecE  47.17 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  34.57 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3646  preprotein translocase subunit SecE  53.06 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.72376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.33 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  36.25 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0613  preprotein translocase subunit SecE  45 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000809702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3351  preprotein translocase subunit SecE  49.06 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2113  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0667  preprotein translocase subunit SecE  42.11 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.986958  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0040  preprotein translocase, SecE subunit  42.11 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  43.86 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0036  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011246  hitchhiker  0.000000000049909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0200  preprotein translocase subunit SecE  46.77 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185504  hitchhiker  0.0000981589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  32.79 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  38.3 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3598  preprotein translocase subunit SecE  51.11 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  47.73 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 
73 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  34.78 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 
60 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  46 
 
 
123 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  32 
 
 
125 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0218  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1669  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00942415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0171  preprotein translocase subunit SecE  46 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  45.45 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  38.71 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  51.16 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3772  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452492  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2042  preprotein translocase subunit SecE  35.29 
 
 
157 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000127265  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0186  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  hitchhiker  0.00751304 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0181  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000171  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  45.1 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0186  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4703  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000037355  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2647  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00996997  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0392  preprotein translocase subunit SecE  49.18 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699813 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3792  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000246891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.33 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  29.27 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3184  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000113463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1908  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3760  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000111945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3822  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0436537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3463  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000635394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  42 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0235  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  0.0123007 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0194  preprotein translocase subunit SecE  30.3 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  25 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  32.47 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  37.7 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  40.38 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  47.83 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  39.68 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  30.95 
 
 
85 aa  43.5  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  32.76 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  34.21 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  39.34 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>