147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0667 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0667  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
60 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.986958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  70 
 
 
60 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  71.67 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  72.88 
 
 
64 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0613  preprotein translocase subunit SecE  70.69 
 
 
61 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000809702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3341  preprotein translocase subunit SecE  67.8 
 
 
61 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0920  preprotein translocase subunit SecE  67.8 
 
 
61 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  49.15 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  56.14 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  45.76 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  42.11 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  47.37 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  48.21 
 
 
115 aa  57.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  37.29 
 
 
60 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  54.55 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  54.55 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  40.68 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  44.83 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  44.23 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2113  preprotein translocase subunit SecE  44.83 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307144  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  38.98 
 
 
65 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  38.98 
 
 
65 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2787  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0354  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 
56 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235186 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  42.31 
 
 
63 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.18 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  51.11 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
62 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.33 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  43.86 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  37.29 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  36.67 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  37.29 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
59 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 
76 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
65 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 
126 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 
126 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 
126 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  39.62 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  31.58 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  32.2 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  38.98 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1211  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1941  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  36.54 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  36.67 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  42.22 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5089  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  42.55 
 
 
52 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746312  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0306  preprotein translocase subunit SecE  40.43 
 
 
117 aa  43.9  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970626  normal  0.0458537 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0194  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3903  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  32.73 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  31.03 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0688  putative SecE preprotein translocase subunit  34.48 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.8362399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  32.2 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.3 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  38.18 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3252  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  33.87 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0972  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836456 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  46.51 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  46.51 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4014  preprotein translocase, SecE subunit  38.18 
 
 
127 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000048748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5446  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
127 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000383194  hitchhiker  0.0067856 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0356  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
127 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
127 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 
127 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>