34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0572 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 60 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 60 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  90 
 
 		 60 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  52.54 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  49.09 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  49.09 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  45.45 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  48.15 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  47.46 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  43.4 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  39.58 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  31.67 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  36.67 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  38.1 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  38.98 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  37.1 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  32.76 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3695  preprotein translocase, SecE subunit  48.84 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000548448  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  35.19 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  39.22 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  36.73 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1149  preprotein translocase, SecE subunit  51.52 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>