96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1026 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 64 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  65.57 
 
 		 76 aa  87.4  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  54.1 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  54.84 
 
 		 62 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  49.18 
 
 		 63 aa  70.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  49.18 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  49.21 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  55 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  49.18 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  51.61 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  47.54 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  55.77 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  53.33 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  53.33 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  51.67 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  47.62 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  51.67 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1318  preprotein translocase subunit SecE  50.82 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0854776  normal  0.244779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1416  preprotein translocase subunit SecE  50.82 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.970626  normal  0.402516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  48.21 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  43.33 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0972  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4443  preprotein translocase, SecE subunit  43.33 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  47.17 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1825  preprotein translocase subunit SecE  46.67 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0959491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  50.91 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  42.37 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  53.49 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1941  preprotein translocase subunit SecE  37.7 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437033  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  37.7 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1211  preprotein translocase subunit SecE  37.7 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.07 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  55.81 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  55.81 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  46.55 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  45.45 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  46.43 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  46.43 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  46.43 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5089  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.14 
 
 		 52 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746312  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  43.1 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  45 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  42.11 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0226  preprotein translocase subunit SecE  44.07 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  47.17 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  44.68 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  49.06 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3846  preprotein translocase, SecE subunit  49.15 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.67 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.67 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  28.33 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  31.03 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  43.4 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0306  preprotein translocase subunit SecE  52.78 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970626  normal  0.0458537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  41.86 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  28.81 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3351  preprotein translocase subunit SecE  46.51 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0392  preprotein translocase subunit SecE  46.55 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699813 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  45.24 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  45.24 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  45.76 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2337  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 125 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0758592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  35.42 
 
 		 72 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3903  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0613  preprotein translocase subunit SecE  40.98 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000809702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3252  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2258  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  40.82 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3457  preprotein translocase subunit SecE  39.22 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164313  normal  0.4312 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  42.59 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3040  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  31.58 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  46.51 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  40.38 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  44.74 
 
 		 51 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  38.1 
 
 		 60 aa  40  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>