58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2548 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 64 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  93.75 
 
 		 64 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  93.75 
 
 		 64 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  93.75 
 
 		 64 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  59.38 
 
 		 66 aa  80.1  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  59.32 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  58.33 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  48.39 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0226  preprotein translocase subunit SecE  67.19 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  54.84 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  56.45 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  53.45 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1416  preprotein translocase subunit SecE  53.23 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.970626  normal  0.402516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  50.82 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0972  preprotein translocase subunit SecE  52.46 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  48.28 
 
 		 63 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1318  preprotein translocase subunit SecE  51.61 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0854776  normal  0.244779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  48.28 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  53.45 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  48.33 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  45 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  46.55 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5089  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  55.1 
 
 		 52 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746312  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4443  preprotein translocase, SecE subunit  43.1 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  44.07 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  43.33 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  43.33 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  46.55 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  50 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1825  preprotein translocase subunit SecE  53.45 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0959491  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1941  preprotein translocase subunit SecE  47.54 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437033  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  47.54 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  46.55 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1211  preprotein translocase subunit SecE  45.9 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  46.15 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  46.67 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  46.67 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.68 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  46 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.44 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3846  preprotein translocase, SecE subunit  46.67 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.67 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  34.78 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 		 115 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  35.48 
 
 		 84 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  36.84 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>