116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3846 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3846  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 98 aa  192  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  67.33 
 
 		 103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  68.37 
 
 		 126 aa  120  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  65.31 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  65.66 
 
 		 101 aa  117  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  65.31 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  67.8 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  60 
 
 		 63 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  58.33 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  59.32 
 
 		 62 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  57.63 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  59.32 
 
 		 62 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  55.93 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  57.63 
 
 		 63 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  62.07 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  55.93 
 
 		 63 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5089  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  60.78 
 
 		 52 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746312  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  39.02 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4443  preprotein translocase, SecE subunit  54.24 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  49.18 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0972  preprotein translocase subunit SecE  56.45 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836456 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  43.21 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  51.85 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  47.54 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  47.89 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  49.15 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  53.85 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  46.67 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1211  preprotein translocase subunit SecE  47.89 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  50.77 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.26 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1941  preprotein translocase subunit SecE  52.46 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437033  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1416  preprotein translocase subunit SecE  49.18 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.970626  normal  0.402516 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1318  preprotein translocase subunit SecE  49.18 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0854776  normal  0.244779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  49.09 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  48.98 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  46.3 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1825  preprotein translocase subunit SecE  48.28 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0959491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  53.06 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0226  preprotein translocase subunit SecE  49.15 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.64 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  31.94 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  40.62 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  41.94 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0688  putative SecE preprotein translocase subunit  38.89 
 
 		 62 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.8362399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  42.59 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2647  preprotein translocase subunit SecE  40.62 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00996997  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3792  preprotein translocase subunit SecE  40.62 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000246891  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0300  preprotein translocase subunit SecE  37.78 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3184  preprotein translocase subunit SecE  40.62 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000113463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1908  preprotein translocase subunit SecE  40.62 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3760  preprotein translocase subunit SecE  40.62 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000111945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3822  preprotein translocase subunit SecE  40.62 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0436537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3463  preprotein translocase subunit SecE  40.62 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000635394  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0040  preprotein translocase, SecE subunit  41.38 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122423  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0235  preprotein translocase subunit SecE  31.46 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  0.0123007 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  42.59 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3658  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000015215  hitchhiker  0.000000741444 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  32.73 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3351  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3433  preprotein translocase subunit SecE  30.12 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2773  preprotein translocase subunit SecE  30.12 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101762  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0334  preprotein translocase subunit SecE  30.12 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000349091  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2258  preprotein translocase subunit SecE  45.16 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0313  preprotein translocase subunit SecE  30.12 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000158246  normal  0.139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  35.38 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3873  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0253  preprotein translocase subunit SecE  30.12 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0223726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0262  preprotein translocase subunit SecE  30.12 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3082  preprotein translocase subunit SecE  39.06 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3340  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4537  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0688027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0504  preprotein translocase subunit SecE  47.92 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0036  preprotein translocase, SecE subunit  40.38 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011246  hitchhiker  0.000000000049909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2854  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.060593  normal  0.309086 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  32.91 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  39.13 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  36.92 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3252  preprotein translocase subunit SecE  47.92 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  41.89 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2973  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3903  preprotein translocase subunit SecE  47.92 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3320  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  34.94 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  39.71 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0306  preprotein translocase subunit SecE  47.62 
 
 		 117 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970626  normal  0.0458537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3040  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3195  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0644038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  38.81 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>