113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0536 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
85 aa  169  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  72.94 
 
 
82 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  59.52 
 
 
84 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  56.76 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  51.25 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  56.14 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  43.68 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  44.87 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  61.11 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  52.86 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  58.18 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  53.7 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  56.36 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  47.19 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  48.78 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  49.09 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  47.3 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  62.5 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  46.34 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  45 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  46.34 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  66.67 
 
 
210 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  49.4 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  60.66 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  42.68 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  36.14 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.37 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  44.12 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  46.84 
 
 
84 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  50.79 
 
 
81 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
92 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  59.26 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.64 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  46.75 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  41.43 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  33.85 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  34.62 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.82 
 
 
64 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  45.16 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  43.64 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  43.55 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  43.55 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3737  preprotein translocase subunit SecE  38.71 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168661  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  33.87 
 
 
125 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  32.43 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  45.45 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 
65 aa  43.5  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  37.1 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  37.1 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  37.1 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 
65 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0200  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185504  hitchhiker  0.0000981589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  33.78 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  43.18 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  47.73 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  35.48 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3891  preprotein translocase subunit SecE  37.7 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00311904  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03857  translocase  36.07 
 
 
127 aa  42  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000542011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4014  preprotein translocase, SecE subunit  36.07 
 
 
127 aa  42  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000048748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  39.39 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  45.45 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  32.43 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4214  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 
127 aa  42  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.05954e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4520  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 
127 aa  42  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4044  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 
127 aa  42  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000141034  hitchhiker  0.00697666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 
127 aa  42  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4469  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 
127 aa  42  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000281914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  51.85 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5446  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 
127 aa  42  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000383194  hitchhiker  0.0067856 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03810  hypothetical protein  36.07 
 
 
127 aa  42  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  35.48 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 
73 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0204  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00011223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1941  preprotein translocase subunit SecE  35.48 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  44.68 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  40.82 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4479  preprotein translocase subunit SecE  36.49 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000837942  decreased coverage  0.00000000000000405738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4476  preprotein translocase subunit SecE  36.49 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000966143  hitchhiker  0.00190417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4357  preprotein translocase subunit SecE  36.49 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000161707  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4389  preprotein translocase subunit SecE  36.49 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4553  preprotein translocase subunit SecE  36.49 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00306238  hitchhiker  0.000000000000770632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  25.32 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0199  preprotein translocase subunit SecE  36.49 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  64.29 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>