63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5089 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5089  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  100 
 
 		 52 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746312  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  90 
 
 		 63 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  88.24 
 
 		 62 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  84.31 
 
 		 63 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  82.35 
 
 		 63 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  80.39 
 
 		 63 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  82 
 
 		 62 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  65.38 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  65.38 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  67.35 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  59.62 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  59.62 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  64 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  57.69 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  64.58 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  54 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0972  preprotein translocase subunit SecE  62 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836456 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  56.25 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1341  preprotein translocase, SecE subunit  52 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0600697  normal  0.152691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  55.1 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  57.14 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  57.14 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  45.1 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  57.14 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  51.02 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  52.08 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1318  preprotein translocase subunit SecE  63.27 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0854776  normal  0.244779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1416  preprotein translocase subunit SecE  63.27 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.970626  normal  0.402516 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  51.16 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1825  preprotein translocase subunit SecE  68 
 
 		 67 aa  52  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0959491  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1941  preprotein translocase subunit SecE  58 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  44.23 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  47.06 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1211  preprotein translocase subunit SecE  58 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  58 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  43.14 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3846  preprotein translocase, SecE subunit  60.78 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4443  preprotein translocase, SecE subunit  50.98 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0226  preprotein translocase subunit SecE  54 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.9 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  39.58 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3340  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  39.22 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  41.18 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2973  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3040  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3195  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0644038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  34.78 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0040  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122423  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3320  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.33 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3351  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38 
 
 		 64 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0235  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  0.0123007 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0036  preprotein translocase, SecE subunit  40.48 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011246  hitchhiker  0.000000000049909 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0262  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3433  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0253  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0223726  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2773  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101762  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0313  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000158246  normal  0.139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0300  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0334  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000349091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>