88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5108 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 84 aa  167  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  73.42 
 
 		 81 aa  116  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  47.95 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  45 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  47.06 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  57.41 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  45.88 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  46.84 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  50.88 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  55.56 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  43.68 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  53.7 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  55.56 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  38.03 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  42.03 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  42.03 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  42.03 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  45.45 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  44.29 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  42.62 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  48.72 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  43.59 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  42.25 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  33.78 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  38.71 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  38.71 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  38.71 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  38.1 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  46.81 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  38.18 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  35.9 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.71 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  47.37 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  36.62 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  48.39 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  37.29 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  38.71 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.51 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  55.56 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  35.48 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3996  preprotein translocase, SecE subunit  40.98 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  36.51 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4365  preprotein translocase, SecE subunit  40.98 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  40.38 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  33.82 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  38.1 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1416  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 		 66 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.970626  normal  0.402516 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  33.9 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1493  preprotein translocase, SecE subunit  35.29 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.394674  normal  0.332847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  39.34 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.77 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  45.61 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  33.8 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4443  preprotein translocase, SecE subunit  42.31 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  37.88 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  33.8 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  30.65 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1941  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 		 66 aa  42  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1318  preprotein translocase subunit SecE  34.43 
 
 		 66 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0854776  normal  0.244779 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  48.21 
 
 		 98 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  37.7 
 
 		 127 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 		 210 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  31.65 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1211  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  31.08 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  37.7 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  36.54 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27751  preprotein translocase subunit SecE  31.67 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0226  preprotein translocase subunit SecE  34.43 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  29.11 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  31.25 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 		 125 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>