86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4357 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 84 aa  170  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  57.14 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  59.52 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  59.46 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  53.25 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  58.18 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  48.28 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  49.4 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  44.57 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  58.18 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  44.57 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.24 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  54.76 
 
 		 82 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  55.56 
 
 		 168 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  50.6 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  61.82 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  44.05 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  70.37 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  45.12 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  50.91 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  64.58 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  47.95 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  52.73 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  61.11 
 
 		 210 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  60.32 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  44.26 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  61.82 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  52.86 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  42.39 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  55.81 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.28 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  52.17 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  43.94 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  45.45 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  39.24 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.75 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.89 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  41.27 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  32.89 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  47.62 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.11 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  36.11 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3737  preprotein translocase subunit SecE  46.94 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  40.48 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4477  preprotein translocase, SecE subunit  32.89 
 
 		 126 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 83 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  45.24 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3891  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00311904  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  46.67 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  29.27 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  38.1 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  39.58 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  45.24 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  41.46 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  38.1 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  45.24 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4014  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000048748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2647  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00996997  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3792  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000246891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3184  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000113463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1908  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3760  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000111945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3822  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0436537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3463  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000635394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03810  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4214  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.05954e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4520  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000132073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03857  translocase  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000542011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4044  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000141034  hitchhiker  0.00697666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4469  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000281914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5446  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000383194  hitchhiker  0.0067856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>