43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2427 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 59 aa  115  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  46.15 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  46.15 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00689  Preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000478021  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  37.93 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.33 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  41.51 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  43.1 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  44.23 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4703  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000037355  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1701  preprotein translocase, SecE subunit  39.22 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0108119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  44.9 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0186  preprotein translocase subunit SecE  44.23 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0181  preprotein translocase subunit SecE  44.23 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000171  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0186  preprotein translocase subunit SecE  44.23 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  hitchhiker  0.00751304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0171  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158213  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  31.58 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  42.31 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0218  preprotein translocase subunit SecE  42.31 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  42.31 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  42.31 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  42.31 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  42.31 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  39.66 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0200  preprotein translocase subunit SecE  40.38 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185504  hitchhiker  0.0000981589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3772  preprotein translocase subunit SecE  42.31 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  37.93 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  36.21 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  39.66 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  45.24 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0496  preprotein translocase, SecE subunit  28.85 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  44.68 
 
 		 84 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>