67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1233 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 147 aa  292  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  80.13 
 
 		 151 aa  239  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  57.43 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  57.43 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  58.11 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  48.12 
 
 		 161 aa  123  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  42.45 
 
 		 158 aa  93.6  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  35.1 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  38.83 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  46.91 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  35.62 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  39.44 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  43.04 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  53.57 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  43.4 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  37.86 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.57 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  35.56 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  38.37 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  43.1 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  37.78 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  44.64 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  36.62 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  42.17 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  31.87 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  56.6 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  35.62 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  47.27 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  37.14 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  35.21 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  46.43 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  32.95 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  48.33 
 
 		 82 aa  48.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  43.28 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  44.12 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  38.96 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  36.49 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  47.27 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  33.78 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.51 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  37.88 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4289  preprotein translocase, SecE subunit  43.75 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573217  hitchhiker  0.00000222433 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  40.38 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 		 84 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  26.37 
 
 		 86 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 		 125 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  38 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  35.42 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2113  preprotein translocase subunit SecE  41.18 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307144  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3195  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0644038  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02351  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 		 85 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>