71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0468 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 65 aa  124  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 65 aa  124  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  68.33 
 
 		 62 aa  82.4  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  58.33 
 
 		 63 aa  76.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  47.62 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  51.11 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  55.81 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 		 60 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.18 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  36.54 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  43.18 
 
 		 51 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  31.75 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  31.67 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  48.94 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  44.19 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  47.62 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  43.4 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  28.07 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  39.53 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  30.51 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  28.07 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  37.93 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  31.67 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  39.53 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  27.59 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1344  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 63 aa  42  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.755781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  44.64 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  40.43 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3474  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 63 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  31.67 
 
 		 61 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 72 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  38.3 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  29.82 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1525  preprotein translocase subunit SecE  41.86 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  41.18 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  32.76 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0920  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  30 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01030  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.89094e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3341  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3862  preprotein translocase, SecE subunit  34.88 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0603678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  30.51 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  29.82 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  38.6 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  48.84 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  31.48 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  31.48 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  30.16 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  26.32 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  24.56 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1701  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 63 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0108119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  42.37 
 
 		 87 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>