57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2660 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  100 
 
 		 81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  73.42 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  56.72 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  55.56 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  48.15 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  47.44 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  43.24 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  52.86 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  52.63 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  55.56 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  49.12 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  54.9 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  48.53 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  44.44 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  57.45 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  48.08 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  34.67 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  46.55 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  46.55 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  46.55 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  34.67 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  46.75 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  40.54 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  42.65 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  45.95 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  55 
 
 		 79 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  35.29 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  43.86 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.38 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1705  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0347  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423362  normal  0.683866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0333  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.06103  normal  0.779327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  51.85 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  34.85 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  37.1 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  36.51 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 		 93 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  33.87 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1941  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437033  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1250  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  34.92 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  35.56 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>